2006-02-08
_ [IT][bio] Molecule of the Month
http://www.rcsb.org/pdb/static.do?p=education_discussion/molecule_of_the_month/index.html
月刊「分子」?今月は“Alpha-amylase”。
_ [books][Chem] ケモインフォマティックス—予測と設計のための化学情報学
日本語で読めるケモインフォマティックスの成書としては唯一かな?ちとお高いが、Amazonで注文。
http://pub.maruzen.co.jp/book_magazine/chemoinfomatics/
_ [IT][Chem] 化合物の生理活性を調べるためのツールたち
Property Explorer : http://www.actelion.com/uninet/www/www_main_p.nsf/Content/Technologies+Property+Explorer
Actelion社のツールの体験版。構造式を入力すると、化合物のDrug-Like特性解析をしてくれる。
Molinspiration Calculation of molecular properties : http://www.molinspiration.com/cgi-bin/properties
4つのターゲットタンパク質(GPCR、Ion channel、Kinase、Nuclear recepter)に対する生理活性特性を予測してくれるWebツール。
Enhanced NCI Database Browser : http://129.43.27.140/ncidb2/
NCI(National Cancer institute)のデータベース検索サービス。CASに登録されている化合物について、様々な化学特性やDruglike判定、PASS法による生理活性特性(319タイプ)の確立値などを一覧で表示。
ALOGPS 2.1 : http://146.107.217.178/lab/alogps/start.html
化合物の疎水性や脂溶性などをあらわすパラメータとして参考とされるLogP値(オクタノール/水分配係数)を、化合物の構造から予想するWebツール。