2006-02-13
_ [IT] ぽっどきゃすてぃんぐ落語【びでお】
いつも電車の中でiPodで聞いて楽しんでいる「ぽっどきゃすてぃんぐ落語」に「びでお」バージョンが登場していた。時々「映像が見られればなぁ・・・」と不満に思っていただけに、うれしい限り。(気づくの遅すぎ・・・)
http://www.podcastjuice.jp/rakugo_video/
しかし、ファイルが大きく、ウチの細い回線ではダウンロードに時間がかかりすぎ!!このためだけに、光を考えてみてしまったり・・・
_ [IT][Chem][bio] バイオインフォマティクスとケモインフォマティクス
バイオインフォマティクスの主な対象は遺伝子とタンパク質である。しかしながらDNAやRNA、タンパク質も化合物である!そしてそれらは化学において強い興味の対象となっている。化学者は核酸やタンパク質の構造や機能の解析において多くの寄与をしてきた。これの意味することははっきりしている。つまりバイオインフォマティクスとケモインフォマティクスとの間に明確な区別はない!
ケモインフォマティクスとバイオインフォマティクスが協力することによってのみ、タンパク質、DNA、RNAの構造、特徴、機能の理解について前進することができる。
_ [IT][bio] タンパク質モデリングツール
MODELLER
http://salilab.org/modeller/
SegMod
http://csb.stanford.edu/levitt/segmod/
SCWRL
http://www1.jcsg.org/scripts/prod/scwrl/serve.cgi
SWISS-MODEL
http://swissmodel.expasy.org/
3D-JIGSAW
http://www.bmm.icnet.uk/servers/3djigsaw/
Verify3D
http://nihserver.mbi.ucla.edu/Verify_3D/
タンパク質立体構造のモデル評価ツール。
BioInfoBank Meta Server
http://bioinfo.pl/Meta/
複数のサーバにクエリーを投げるためのMetaサーバ。ただし、メールアドレスや検索中の途中経過などは全て公開されてしまうので注意。
VAST
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Structure/VAST/
NCBIで公開しているタンパク質類似立体構造検索サービス。