tetraの外部記憶箱

_ [IT][bio] タンパク質解析ツールいろいろ

InterProScan
http://www.ebi.ac.uk/InterProScan/
UniProt、Pfam、PROSITEなどの各種モチーフデータベースを参照し、配列中のモチーフを検索するWebツール。

PSORT
http://psort.hgc.jp/
タンパク質の局在予測ツール。

SignalP
http://www.cbs.dtu.dk/services/SignalP/
シグナルペプチド予測ツール。

TMHMM Server
http://www.cbs.dtu.dk/services/TMHMM/
膜貫通領域およびトポロジー（N端が内か外か）の予測ツール。

sc-PDB
http://bioinfo-pharma.u-strasbg.fr/scPDB/
構造式やLipinskiルールからPDBのリガンド分子を検索するツール。

DrugBank
http://redpoll.pharmacy.ualberta.ca/drugbank/
薬剤とその標的タンパク質を収載したデータベース。

CASTp
http://sts.bioengr.uic.edu/castp/
立体構造中の活性ポケット探索ツール。PDBのIDから検索できる他に、自分でモデリングしたタンパク質などをサーバにUploadして解析する事もできる。

Catalytic Site Atlas
http://www.ebi.ac.uk/thornton-srv/databases/CSA/
触媒部位予測ツール。

_ [news] 堀江メール 偽造説優勢

ホリエモンが武部幹事長の次男の口座へ資金を振り込むように指示したと言うメールについて、ネット上ではヘッダーやなどに不自然な点が多い事から「偽造」との見方が強まっているようだ。